MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 1687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	TGC	2	6	96	101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611994
2	NC_017639	CTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611994
3	NC_017639	CT	3	6	233	238	0 %	50 %	0 %	50 %	386611994
4	NC_017639	TACC	2	8	289	296	25 %	25 %	0 %	50 %	386611994
5	NC_017639	CCGA	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	386611994
6	NC_017639	TGC	2	6	364	369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611994
7	NC_017639	AGG	2	6	384	389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611994
8	NC_017639	GCC	2	6	395	400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611994
9	NC_017639	GC	3	6	401	406	0 %	0 %	50 %	50 %	386611994
10	NC_017639	ACAG	2	8	429	436	50 %	0 %	25 %	25 %	386611994
11	NC_017639	CAGA	2	8	524	531	50 %	0 %	25 %	25 %	386611994
12	NC_017639	CGT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611994
13	NC_017639	CGT	2	6	686	691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611994
14	NC_017639	CCT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017639	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017639	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017639	GCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017639	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017639	TCA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017639	ACT	2	6	1056	1061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611995
21	NC_017639	CCTGT	2	10	1098	1107	0 %	40 %	20 %	40 %	386611995
22	NC_017639	GACA	2	8	1109	1116	50 %	0 %	25 %	25 %	386611995
23	NC_017639	GCG	2	6	1138	1143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611995
24	NC_017639	ACA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611995
25	NC_017639	CA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	0 %	50 %	386611995
26	NC_017639	AAC	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611995
27	NC_017639	CCCT	2	8	1231	1238	0 %	25 %	0 %	75 %	386611995
28	NC_017639	GCC	3	9	1253	1261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611995
29	NC_017639	CCCG	2	8	1262	1269	0 %	0 %	25 %	75 %	386611995
30	NC_017639	AAC	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611995
31	NC_017639	TGT	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611995
32	NC_017639	CAT	3	9	1314	1322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611995
33	NC_017639	TCT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611995
34	NC_017639	TCG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611995
35	NC_017639	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	386611995
36	NC_017639	CGG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017639	GCC	2	6	1579	1584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017639	ACA	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017639	TA	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	386611996
40	NC_017639	GTTAAT	2	12	1666	1677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386611996
41	NC_017639	GTT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611996
42	NC_017639	GAA	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611996
43	NC_017639	CAT	3	9	1912	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611996
44	NC_017639	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611996
45	NC_017639	CGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611997
46	NC_017639	GAA	3	9	2076	2084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611997
47	NC_017639	TTGC	2	8	2106	2113	0 %	50 %	25 %	25 %	386611997
48	NC_017639	ACA	2	6	2200	2205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611997
49	NC_017639	TGCG	2	8	2246	2253	0 %	25 %	50 %	25 %	386611997
50	NC_017639	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	386611997
51	NC_017639	TGAA	2	8	2283	2290	50 %	25 %	25 %	0 %	386611997
52	NC_017639	G	6	6	2291	2296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017639	GCT	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017639	CTG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017639	TCCG	2	8	2448	2455	0 %	25 %	25 %	50 %	386611998
56	NC_017639	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611998
57	NC_017639	TCA	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611998
58	NC_017639	AGA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611998
59	NC_017639	CAGCA	2	10	2636	2645	40 %	0 %	20 %	40 %	386611998
60	NC_017639	TCT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611998
61	NC_017639	AAG	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611998
62	NC_017639	CTT	2	6	2746	2751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611998
63	NC_017639	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017639	GAA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017639	TTTTC	2	10	3011	3020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017639	CCTGG	2	10	3045	3054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017639	TGC	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611999
68	NC_017639	GCCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	25 %	50 %	386611999
69	NC_017639	CAC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611999
70	NC_017639	CAG	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611999
71	NC_017639	CAA	2	6	3358	3363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611999
72	NC_017639	CAGC	2	8	3395	3402	25 %	0 %	25 %	50 %	386611999
73	NC_017639	T	6	6	3509	3514	0 %	100 %	0 %	0 %	386611999
74	NC_017639	CGG	2	6	3690	3695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017639	CAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017639	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017639	CAT	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017639	GCA	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017639	TTGTTT	2	12	3839	3850	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017639	T	7	7	3887	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017639	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017639	TGTGC	2	10	3909	3918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017639	TGT	3	9	3924	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017639	T	6	6	3935	3940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017639	CGT	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017639	TGT	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017639	TGC	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017639	T	7	7	4135	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017639	GAA	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017639	GCT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017639	GA	3	6	4250	4255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017639	GTC	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017639	TTA	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017639	T	7	7	4403	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017639	A	6	6	4427	4432	100 %	0 %	0 %	0 %	386612000
96	NC_017639	TTA	2	6	4439	4444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612000
97	NC_017639	T	8	8	4452	4459	0 %	100 %	0 %	0 %	386612000
98	NC_017639	GTG	2	6	4517	4522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612000
99	NC_017639	TGG	3	9	4539	4547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612000
100	NC_017639	CCG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612000
101	NC_017639	TTTCGT	2	12	4880	4891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386612000
102	NC_017639	TGT	2	6	4951	4956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612000
103	NC_017639	AGT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612000
104	NC_017639	A	6	6	4984	4989	100 %	0 %	0 %	0 %	386612001
105	NC_017639	ACA	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612001
106	NC_017639	CGG	2	6	5054	5059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
107	NC_017639	G	11	11	5115	5125	0 %	0 %	100 %	0 %	386612001
108	NC_017639	AGG	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612001
109	NC_017639	TAA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612001
110	NC_017639	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612001
111	NC_017639	TTC	2	6	5577	5582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612001
112	NC_017639	GCG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
113	NC_017639	CCA	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612001
114	NC_017639	CTG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612001
115	NC_017639	AAC	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612001
116	NC_017639	TGACAC	2	12	5822	5833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612001
117	NC_017639	TGC	2	6	5846	5851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612001
118	NC_017639	CGG	2	6	5867	5872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
119	NC_017639	GTG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612001
120	NC_017639	GCA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612001
121	NC_017639	GT	3	6	6062	6067	0 %	50 %	50 %	0 %	386612001
122	NC_017639	GCG	2	6	6070	6075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
123	NC_017639	TACGGT	2	12	6079	6090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612001
124	NC_017639	GGAC	2	8	6093	6100	25 %	0 %	50 %	25 %	386612001
125	NC_017639	CTG	2	6	6191	6196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612001
126	NC_017639	AAC	2	6	6269	6274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612001
127	NC_017639	GAC	2	6	6279	6284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612001
128	NC_017639	TCC	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386612001
129	NC_017639	GAATG	2	10	6400	6409	40 %	20 %	40 %	0 %	386612001
130	NC_017639	TCAG	2	8	6416	6423	25 %	25 %	25 %	25 %	386612001
131	NC_017639	GTT	2	6	6435	6440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612001
132	NC_017639	TTA	2	6	6471	6476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612001
133	NC_017639	G	6	6	6608	6613	0 %	0 %	100 %	0 %	386612001
134	NC_017639	CAG	3	9	6675	6683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612001
135	NC_017639	GGT	2	6	6775	6780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612001
136	NC_017639	TGG	2	6	6792	6797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612001
137	NC_017639	CAG	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612001
138	NC_017639	GTG	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612001
139	NC_017639	CGG	2	6	6873	6878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
140	NC_017639	CGG	2	6	6923	6928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612001
141	NC_017639	CAT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612001
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253	NC_017639	TGGCAG	2	12	11746	11757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386612007
254	NC_017639	TGCAG	2	10	11787	11796	20 %	20 %	40 %	20 %	386612007
255	NC_017639	CTGGC	2	10	11798	11807	0 %	20 %	40 %	40 %	386612007
256	NC_017639	CAT	2	6	11939	11944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612007
257	NC_017639	TCT	2	6	12021	12026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612007
258	NC_017639	CG	3	6	12168	12173	0 %	0 %	50 %	50 %	386612007
259	NC_017639	TGT	2	6	12206	12211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612007
260	NC_017639	GAG	2	6	12292	12297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612007
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262	NC_017639	TGG	2	6	12381	12386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017639	TGGT	2	8	12388	12395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017639	TG	3	6	12399	12404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017639	TGG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017639	TGC	2	6	12501	12506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612008
267	NC_017639	CCTC	2	8	12519	12526	0 %	25 %	0 %	75 %	386612008
268	NC_017639	GC	3	6	12623	12628	0 %	0 %	50 %	50 %	386612008
269	NC_017639	CTG	2	6	12648	12653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612008
270	NC_017639	TCG	2	6	12666	12671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612008
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273	NC_017639	ATT	2	6	12765	12770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017639	CGG	2	6	12876	12881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612009
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349	NC_017639	CCAC	2	8	16865	16872	25 %	0 %	0 %	75 %	386612014
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383	NC_017639	CGG	2	6	18671	18676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612016
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391	NC_017639	GAA	2	6	18966	18971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612016
392	NC_017639	TTC	2	6	18982	18987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612016
393	NC_017639	TGT	2	6	19019	19024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612016
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395	NC_017639	AATA	2	8	19350	19357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_017639	TTG	2	6	19376	19381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017639	A	7	7	19421	19427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_017639	TTC	2	6	19503	19508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_017639	CT	3	6	19529	19534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
400	NC_017639	AT	3	6	19605	19610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_017639	AATAA	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017639	AATG	2	8	19704	19711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
403	NC_017639	T	8	8	19721	19728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017639	ATA	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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